生物統計学 2016年度

レポート用紙

第1回:統計解析を始める前に

  • スライド資料 
  • 実習資料 

第2回:注目要素を決める(木を見る)

  • スライド資料 
  • 実習資料 
  • 遺伝子発現データ(圧縮) 
  • 遺伝子発現データの実験情報 
  • 遺伝子発現データの実験ID対応表 

第3回:全体を眺める・1(Rとクラスタリング)

  • スライド資料 
  • 実習資料 

第4回:全体を眺める・2(平均や分散など)

  • スライド資料 
  • 実習資料 

第5回:違いを調べる・1(t検定)

  • スライド資料 
  • 実習資料 

第6回:違いを調べる・2(U検定)

  • スライド資料 
  • 実習資料 

第7回:違いを調べる・3(カイ二乗検定)

  • スライド資料 
  • 実習資料 

第8回:エラーを調べる(2種類の過誤、外れ値)

  • スライド資料 
  • 実習資料 

第9回:違いを調べる・4(p値とFDR

  • スライド資料 
  • 実習資料 
  • 遺伝子発現データの実験情報 

第10回:類似性を調べる(ピアソン、スピアマン、回帰分析)

  • スライド資料 
  • 実習資料 
  • スピアマン相関係数を計算するPerlプログラム(圧縮ファイル) 

第11回:全体を眺める・3(主成分分析・1)

  • スライド資料 
  • 実習資料 
  • 主成分分析用の遺伝子発現データ 

第12回:全体を眺める・4(主成分分析・2)

  • スライド資料 
  • 実習資料 
  • 主成分分析用の遺伝子発現データ 

第13回:全体を眺める・5(主成分分析・3)

  • スライド資料 
  • 実習資料 
  • 主成分分析用の遺伝子発現データ 
  • 遺伝子発現データ(圧縮、グラフ作成機能付き) 

第14回:全体を眺める・6(相関ネットワーク解析)

  • スライド資料 
  • 実習資料 
  • 遺伝子発現データ(圧縮、グラフ作成機能付き) 
  • ネットワーク解析ソフトPajek(圧縮ファイル) 
  • ネットワークファイル(圧縮ファイル) 

第15回:期末レポートの説明

  • スライド資料 
  • 期末レポートの解析の手順書 

期末レポート

  • 期末レポートの解析の手順書(2月2日改訂版です!! ) 
  • 遺伝子発現データ 
  • 遺伝子発現グラフ作成エクセルファイル(圧縮) 
  • 遺伝子発現グラフ作成エクセルファイルの使い方 
  • ネットワークファイル(圧縮) 
kagiana1